
Ну наверно, у страниц сайта которые в sitemap, больше приоритет, чем у страниц того-же сайта, не внесенных в него.
Получается что у 99% сайтов без GoogleSiteMap Гугл ничего не индексирует?
Какие-то у вас скоропостижные выводы, в неправильном направлении. Вроде бы sitemap специально создан для ускоренного нахождение Google’ом претерпевших изменения страниц сайта.
Кстати настройки в структуре "Google SiteMap" и "Карта сайта", как то связаны или нет?