ashot, в приведенном вами XSL-шаблоне вложенные узлы структуры вообще не обрабатываются. Естественно в такой ситуации их доп. свойства также никак не учитываются. У вас обрабатываются только узлы первого уровня.
Если вам требуется выводить содержимое определенного доп. свойства
текущего узла структуры, то нужно использовать код:
<xsl:template match="structure">
<xsl:if test="@id=current_structure_id">
<xsl:value-of disable-output-escaping="yes" select="propertys/property[@name='string1']/value"/>
</xsl:if>
<xsl:apply-templates select="structure"/>
</xsl:template>