Только сейчас я понял всю суть проблемы целиком, просто я работаю на маке и у меня файлы с точкой это системные файлы, и они скрыты системой, именно поэтому я его не скопировал в 1 раз...
Прошу прощения за отнятое время и спасибо за помощь.
P.S. Так как эта тема была в "Вопрос-Ответ" может стоит её дополнить сообщением для *nix систем, чтобы файл не терялся)))
toropov,
В *nix системах при нормальной настройке файлы с точкой в начале замечательно показываются. Mac не совсем (а сейчас скорее даже совсем не) *nix система, для него сделаем отдельную пометку в руководстве. Внимание! в системе много .htaccess файлов, если Вы часть не скопировали - это может быть угрозой безопасности. Повторите копирование системы со всеми .htaccess файлами.