При попытке сделать экспорт в CSV полей форм ЦА получаемый файл создается в кодировке UTF-8 и при открытии в MS Excel выглядит вот так:
Версия системы 5.9.17, константа ALT_SITE_LOCALE со значением ru_RU.CP1251 создана и активна (хотя судя по ее описанию в тексте обновления 5.9.16 она воздействует только на импорт а не на экспорт).