Удаленные товары все равно отображаются в каталоге (баг?)

Возникла следующая проблема: удалили группы, содержащие демо-товары (холодильники, плееры и проч., что ставится вместе с CMS), сделали вывод товаров на странице из всех групп ($Shop_Controller_Show->group(FALSE), а там отображаются эти самые старые товары.
Кстати, удалить их теперь, никак не получается, т. к. групп в админке нет, а переход по ссылке товара выдает ошибку.

Это не баг. Товары из помеченных на удаление групп пока никуда не делись.
Чтобы удалить окончательно группы и все, что с ними связано, перейдите в модуль "Корзина" и там их удалите.

Тогда кажется нелогичным, что они остаются видны пользователям сайта... =/

они видны из-за выборки из всех групп, при такой выборке неудаленность группы никак не проверяется.
Объединяйте с таблицей групп с проверкой у группы на deleted = 0, тогда ограничение будет работать корректно, однако нагрузка вырастет.