Зачем вот это?
<div class="1">
<div class="2">
<div class="3">
<div class="4">
<div class="5">
<!-- Выбираем узлы структуры -->
<xsl:apply-templates select="structure[show=1]"/>
</div>
</div>
</div>
</div >
</div>
Вот здесь делаем div без класса (class="podmenu" убрать):
<div class="podmenu">
<!-- Выбираем узлы структуры -->
<xsl:apply-templates select="structure[show=1]"/>
</div>
а вот это вкладываем в Div:
<div class="x">
<!-- Выбираем узлы структуры -->
<xsl:apply-templates select="structure[show=1]"/>
</div>