Eklmn, работа модулей "Поиск" и "Информационные системы" базируются на различных принципах, они оперируют совершенно различными сущностями и их параметрами.
По поводу кода(для доп. свойства с именем тэга domen, например):
<a href="http://{item_propertys/item_property[@xml_name='domen']/value}{item_path}">
<xsl:value-of disable-output-escaping="yes" select="item_name"/></a>
Отнести шаблоны страниц, макеты и пр. к определенному сайту можно с помощью SQL-запроса(вместо 1 укажите идентификатор вашего сайта):
-- Указание ID сайта
UPDATE `documents_dir_table` SET `site_id` = 1;
UPDATE `documents_table` SET `site_id` = 1;
UPDATE `documents_status_table` SET `site_id` = 1;
UPDATE `lists_table` SET `site_id` = 1;
UPDATE `forms_table` SET `site_id` = 1;
UPDATE `templates_table` SET `site_id` = 1;
UPDATE `data_templates_table` SET `site_id` = 1;